Το Τμήμα Αυτεπαγγέλτων Ελέγχων είναι αρμόδιο για τη διενέργεια ελέγχων στους φορείς που προβλέπονται στην κείμενη νομοθεσία. Οι έλεγχοι επικεντρώνονται σε ιδιαίτερης σημασίας, ως προς τις αρμοδιότητες της Α.Δ.Α.Ε., πληροφοριακά ή επικοινωνιακά συστήματα ή/και δίκτυα παρόχων, για τη διαπίστωση της τήρησης της σχετικής κείμενης νομοθεσίας.
Στις αρμοδιότητες του Τμήματος περιλαμβάνονται:
- Ο προγραμματισμός και η εισήγηση προς την Ολομέλεια της Α.Δ.Α.Ε. για τη διενέργεια ελέγχου στους φορείς που προβλέπονται στην κείμενη νομοθεσία, καθώς και η πραγματοποίηση του ελέγχου.
- Η σύνταξη της έκθεσης ελέγχου και η εισήγηση προς την Ολομέλεια της Α.Δ.Α.Ε. για την έγκριση των αποτελεσμάτων του διενεργηθέντος ελέγχου.
- Η συνδρομή σε ελέγχους που πραγματοποιούν φορείς του Δημοσίου και εμπίπτουν στις αρμοδιότητες της Α.Δ.Α.Ε.
- Η παροχή στοιχείων, στατιστικών δεδομένων, αναλύσεων και σχετικών με τις αρμοδιότητες του Τμήματος πληροφοριών στις υπηρεσίες και στην Ολομέλεια της Α.Δ.Α.Ε.